MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp5

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021227	GTT	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148293
2	NC_021227	A	7	7	1122	1128	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
3	NC_021227	ATT	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148293
4	NC_021227	ATT	2	6	1214	1219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148293
5	NC_021227	TGA	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
6	NC_021227	AAT	2	6	1316	1321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
7	NC_021227	CTA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148293
8	NC_021227	GTC	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148293
9	NC_021227	A	6	6	1560	1565	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
10	NC_021227	ATAA	2	8	1580	1587	75 %	25 %	0 %	0 %	501148293
11	NC_021227	TA	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	501148293
12	NC_021227	TA	4	8	1661	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	501148293
13	NC_021227	AAT	2	6	1795	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
14	NC_021227	AT	3	6	1828	1833	50 %	50 %	0 %	0 %	501148293
15	NC_021227	ATA	2	6	1856	1861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
16	NC_021227	ATA	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
17	NC_021227	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
18	NC_021227	TGA	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
19	NC_021227	GTT	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148293
20	NC_021227	ATTT	2	8	2097	2104	25 %	75 %	0 %	0 %	501148293
21	NC_021227	GAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148293
22	NC_021227	T	6	6	2113	2118	0 %	100 %	0 %	0 %	501148293
23	NC_021227	A	6	6	2136	2141	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
24	NC_021227	CA	3	6	2154	2159	50 %	0 %	0 %	50 %	501148293
25	NC_021227	CCAT	2	8	2218	2225	25 %	25 %	0 %	50 %	501148293
26	NC_021227	ATAC	2	8	2248	2255	50 %	25 %	0 %	25 %	501148293
27	NC_021227	A	6	6	2331	2336	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
28	NC_021227	AGT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
29	NC_021227	T	6	6	2380	2385	0 %	100 %	0 %	0 %	501148293
30	NC_021227	CA	4	8	2400	2407	50 %	0 %	0 %	50 %	501148293
31	NC_021227	A	6	6	2490	2495	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
32	NC_021227	A	6	6	2555	2560	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
33	NC_021227	TGTTGA	2	12	2585	2596	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501148293
34	NC_021227	GAAA	2	8	2631	2638	75 %	0 %	25 %	0 %	501148293
35	NC_021227	TAA	3	9	2649	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
36	NC_021227	T	7	7	2665	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	501148293
37	NC_021227	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	501148293
38	NC_021227	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
39	NC_021227	TTA	2	6	2829	2834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148294
40	NC_021227	ACA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148294
41	NC_021227	TCA	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148294
42	NC_021227	TCAA	2	8	3049	3056	50 %	25 %	0 %	25 %	501148295
43	NC_021227	GAA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148295
44	NC_021227	GGA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148305
45	NC_021227	CCA	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
46	NC_021227	GAA	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148305
47	NC_021227	GCC	2	6	4525	4530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
48	NC_021227	ATT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148305
49	NC_021227	CTT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148305
50	NC_021227	GGC	2	6	4671	4676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
51	NC_021227	CTG	3	9	4699	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
52	NC_021227	CAC	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
53	NC_021227	GCCA	2	8	4830	4837	25 %	0 %	25 %	50 %	501148305
54	NC_021227	AAAC	2	8	4969	4976	75 %	0 %	0 %	25 %	501148305
55	NC_021227	GTG	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
56	NC_021227	TCAAG	2	10	5121	5130	40 %	20 %	20 %	20 %	501148305
57	NC_021227	GC	3	6	5161	5166	0 %	0 %	50 %	50 %	501148305
58	NC_021227	ACC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
59	NC_021227	TGA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
60	NC_021227	TGG	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
61	NC_021227	TGG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
62	NC_021227	TC	3	6	5256	5261	0 %	50 %	0 %	50 %	501148305
63	NC_021227	CGCTG	2	10	5265	5274	0 %	20 %	40 %	40 %	501148305
64	NC_021227	CT	3	6	5284	5289	0 %	50 %	0 %	50 %	501148305
65	NC_021227	CGG	2	6	5333	5338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
66	NC_021227	AAC	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148305
67	NC_021227	CCA	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
68	NC_021227	AAATG	2	10	5472	5481	60 %	20 %	20 %	0 %	501148305
69	NC_021227	TGG	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
70	NC_021227	ATC	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
71	NC_021227	TGA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
72	NC_021227	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
73	NC_021227	GCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
74	NC_021227	CGA	3	9	5640	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
75	NC_021227	GCC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
76	NC_021227	ATCG	2	8	5716	5723	25 %	25 %	25 %	25 %	501148305
77	NC_021227	GACATC	2	12	5755	5766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501148305
78	NC_021227	ATG	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
79	NC_021227	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
80	NC_021227	CGA	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
81	NC_021227	AGC	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
82	NC_021227	CAT	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
83	NC_021227	CGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
84	NC_021227	ACC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
85	NC_021227	TGA	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
86	NC_021227	CCGC	2	8	6173	6180	0 %	0 %	25 %	75 %	501148305
87	NC_021227	AGC	2	6	6239	6244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
88	NC_021227	AGC	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
89	NC_021227	GC	3	6	6336	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	501148305
90	NC_021227	GCT	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
91	NC_021227	CGC	2	6	6462	6467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
92	NC_021227	GAT	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
93	NC_021227	CAC	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
94	NC_021227	GCCG	2	8	6520	6527	0 %	0 %	50 %	50 %	501148305
95	NC_021227	ACC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
96	NC_021227	GCT	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
97	NC_021227	TGA	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
98	NC_021227	GGC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
99	NC_021227	CAC	2	6	6648	6653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
100	NC_021227	ATG	2	6	6728	6733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
101	NC_021227	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
102	NC_021227	GCATG	2	10	6789	6798	20 %	20 %	40 %	20 %	501148305
103	NC_021227	TGGG	2	8	6830	6837	0 %	25 %	75 %	0 %	501148305
104	NC_021227	GCG	2	6	6881	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
105	NC_021227	CG	3	6	6948	6953	0 %	0 %	50 %	50 %	501148305
106	NC_021227	TGC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
107	NC_021227	CGG	2	6	7022	7027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
108	NC_021227	CAT	2	6	7047	7052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
109	NC_021227	TTC	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148305
110	NC_021227	TGC	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
111	NC_021227	CGCC	2	8	7180	7187	0 %	0 %	25 %	75 %	501148305
112	NC_021227	ATC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148306
113	NC_021227	CTA	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148306
114	NC_021227	TCT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148307
115	NC_021227	CAA	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148307
116	NC_021227	CAT	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148307
117	NC_021227	AAC	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148307
118	NC_021227	AATT	2	8	7822	7829	50 %	50 %	0 %	0 %	501148307
119	NC_021227	AGA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148307
120	NC_021227	CAGC	2	8	8327	8334	25 %	0 %	25 %	50 %	501148296
121	NC_021227	CTG	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
122	NC_021227	GTT	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
123	NC_021227	TTTG	2	8	8495	8502	0 %	75 %	25 %	0 %	501148296
124	NC_021227	CTGA	2	8	8520	8527	25 %	25 %	25 %	25 %	501148296
125	NC_021227	TGC	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
126	NC_021227	TGC	2	6	8603	8608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
127	NC_021227	GTT	2	6	8616	8621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
128	NC_021227	GTC	2	6	8626	8631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
129	NC_021227	GTTG	2	8	8639	8646	0 %	50 %	50 %	0 %	501148296
130	NC_021227	TTG	2	6	8649	8654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
131	NC_021227	TGA	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148296
132	NC_021227	GTT	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
133	NC_021227	TTG	2	6	8775	8780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
134	NC_021227	GTTC	2	8	8789	8796	0 %	50 %	25 %	25 %	501148296
135	NC_021227	TGGT	2	8	8804	8811	0 %	50 %	50 %	0 %	501148296
136	NC_021227	TGT	2	6	8957	8962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148297
137	NC_021227	GTC	2	6	8968	8973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148297
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141	NC_021227	T	6	6	9493	9498	0 %	100 %	0 %	0 %	501148297
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150	NC_021227	TTTG	2	8	9836	9843	0 %	75 %	25 %	0 %	501148298
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162	NC_021227	GTG	2	6	10697	10702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148299
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171	NC_021227	TGAA	2	8	11431	11438	50 %	25 %	25 %	0 %	501148301
172	NC_021227	GTTT	2	8	11479	11486	0 %	75 %	25 %	0 %	501148301
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212	NC_021227	CAG	2	6	15661	15666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148304
213	NC_021227	ATG	2	6	15699	15704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148304

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.